Entre1996/1998, o CJC desenvolveu uma pesquisa sobre a Gestão Democrática das Grandes Cidades, financiada pela Comunidade Econômica Européia. Tratava-se de observar o que havia mudado nessas cidades, após 10 anos de eleições diretas para prefeitos nas grandes cidades e capitais brasileiras, para o que se realizou estudos de caso em Recife, Fortaleza, Santos e Porto Alegre. Além de uma monografia sobre cada município pesquisado e da realização de inúmeras oficinas com Gestores Públicos e Movimentos Sociais, um dos resultados dessa pesquisa foi a publicação do livro Gestão Democrática das Grandes Cidades, publicado pela Cortez Editora em 1998.